Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms