Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA8P53708 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms