Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMARCA2P51531 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms