Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXNP49023 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXNP49023 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXNP49023 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXNP49023 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXNP49023 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms