Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNBP48739 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms