Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RANGAP1P46060 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms