Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNT2P45379 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT2P45379 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms