Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL15A1P39059 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL15A1P39059 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms