Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms