Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms