Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPC1P35052 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms