Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASQ1P31415 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms