Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHMLP26374 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHMLP26374 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHMLP26374 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHMLP26374 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms