Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA2P26232 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNA2P26232 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms