Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EFNA1P20827 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms