Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PVALBP20472 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PVALBP20472 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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