Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATF1P18846 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATF1P18846 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATF1P18846 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms