Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BPIP17213 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BPIP17213 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BPIP17213 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPIP17213 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIP17213 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIP17213 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIP17213 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIP17213 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BPIP17213 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms