Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms