Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAV1P15498 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms