Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXD8P13378 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms