Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ACTN1P12814 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTN1P12814 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms