Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLBP1P12271 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms