Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLUP10909 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLUP10909 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLUP10909 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLUP10909 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLUP10909 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLUP10909 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLUP10909 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms