Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms