Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C8orf89P0DMQ9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C8orf89P0DMQ9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms