Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms