Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGA10O75578 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.2 ms