Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GMDSO60547 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GMDSO60547 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms