Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPLO60437 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPLO60437 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPLO60437 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPLO60437 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPLO60437 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPLO60437 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPLO60437 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms