Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX5O60225 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX5O60225 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX5O60225 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX5O60225 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX5O60225 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX5O60225 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX5O60225 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX5O60225 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX5O60225 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX5O60225 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms