Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms