Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP2O14595 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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