Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS6O14544 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOCS6O14544 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms