Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms