Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN34H7C241 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms