Protein–RNA interactions for Protein: C9JTQ0

ANKRD63, Ankyrin repeat domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD63C9JTQ0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD63C9JTQ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD63C9JTQ0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms