Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms