Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMEM200CA6NKL6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms