Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IRGMA1A4Y4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRGMA1A4Y4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms