Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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