Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PIAS3Q9Y6X2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms