Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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SNX13Q9Y5W8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX13Q9Y5W8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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