Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms