Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF13Q9Y2Y9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms