Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM2AQ9Y2K7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM2AQ9Y2K7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms