Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEU3Q9UQ49 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms