Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INO80Q9ULG1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms