Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms