Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMPRSS11EQ9UL52 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms